Ο συγγραφέας του ευαγγελίου Ότι το δ' ευαγγέλιο είναι έργο του Ιωάννη του μαθητή του Κυρίου αποτελεί σταθερή παράδοση της Εκκλησίας από το 2° ήδη μ.Χ. αιώνα. Σαφώς ο Ειρηναίος αποδίδοντας τη συγγραφή του ευαγγελίου στον Ιωάννη γράφει: «Έπειτα ο Ιωάννης, ο μαθητής του Κυρίου ο και επί του στήθους αυτού αναπεσών, και αυτός εξέδωκε το ευαγγέλιον, εν Εφέσω της Ασίας διατρίβων» (βλ. Ευσεβίου, Έκκλ. Ιστορία Ε' 8,4). Ο Κλήμης ο Αλεξανδρέας άλλωστε χαρακτηρίζει το δ' ευαγγέλιο «πνευματικό» και παρατηρεί τα εξής: «Τον μεν Ιωάννην έσχατον συνιδόντα ότι τα σωματικά εν τοις ευαγγελίοις δεδήλωται, προτραπέντα υπό των γνωρίμων, πνεύματι θεοφορηθέντα…